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Pesquisa aplicada, MBA em Inteligência Artificial e Big Data no ICMC-USP

Retinopatia diabética entre bases

Medida de quanto o pré-processamento de imagem sustenta a generalização de redes convolucionais quando o modelo treinado numa base de fundo de olho é aplicado, sem adaptação, em outra. Seis configurações, três pré-processamentos em duas arquiteturas, treinadas em 35.126 imagens e avaliadas em 1.744 de outra procedência.

Papel
Autor, orientação Profa. Dra. Agma J. M. Traina
Período
2026
Situação
Monografia concluída, 58 páginas
Gráfico da queda da AUC ao mudar de base: baseline 9,9%, CLAHE 7,0% e canal verde 0,2%.

Arquitetura

  • Protocolo cross-dataset: treino exclusivamente em EyePACS e avaliação em Messidor-2, sem nenhuma adaptação. Nenhuma imagem do Messidor-2 participa do treino nem da seleção de checkpoint.
  • Rótulo binarizado pelo mesmo critério nas duas bases: grau 0 da escala de severidade vira classe negativa, graus 1 a 4 viram classe positiva, o que corresponde à decisão de encaminhar ou não.
  • Split intra-base agrupado por paciente: 17.563 pacientes do EyePACS, dois olhos cada, divididos em 14.050 para treino e 3.513 para validação, com zero sobreposição de paciente e 26,5% de positivos dos dois lados.
  • Três pré-processamentos comparados: redimensionamento puro como baseline, realce local de contraste com CLAHE no canal L do espaço LAB, e extração do canal verde replicado nos três canais.
  • Duas arquiteturas de capacidade diferente: uma SimpleCNN de 1.146.561 parâmetros treinada do zero, com campo receptivo de 36 por 36 pixels, e uma EfficientNet-B0 de 4.008.829 parâmetros inicializada em ImageNet, com fine-tuning de todas as camadas.
  • Receita de treino idêntica entre variantes: BCEWithLogitsLoss com pos_weight 2,77, AdamW, CosineAnnealingLR, batch efetivo 32 por acumulação de gradiente, precisão mista e aumento de dados por espelhamento, rotação e perturbação de brilho.
  • Métricas com intervalo de confiança de 95% por bootstrap de 2.000 réplicas: AUC-ROC, sensibilidade, especificidade, precisão, F1 e matriz de confusão.
  • Dois pontos de operação reportados: limiar padrão 0,5 e limiar calibrado na validação para sensibilidade mínima de 0,90, depois transferido para a base externa sem reajuste.
  • Grad-CAM implementado com hooks na última camada convolucional, compartilhado entre a figura da monografia e uma demonstração web em Gradio que carrega os seis checkpoints.

Detalhes de implementação

  • O filtro roda na resolução nativa e só depois a imagem cai para 512 por 512, porque o CLAHE depende da estatística de vizinhança e microaneurisma ocupa poucos pixels no original.
  • O intervalo de confiança vem de um bootstrap que reamostra os 874 exames, não as imagens soltas, porque 86,3% dos pares de olhos têm rótulo concordante.
  • O melhor checkpoint é escolhido pela AUC de validação do EyePACS, nunca pela base externa, e a AUC é calculada por estatística U de Mann-Whitney implementada no próprio projeto.

Tecnologias

Python
Linguagem de todo o experimento, em treze scripts.
PyTorch
Treino, fine-tuning e inferência das duas arquiteturas.
torchvision
EfficientNet-B0 com pesos de ImageNet e as transformações de imagem.
OpenCV
CLAHE no canal L do LAB e a separação do canal verde.
NumPy e pandas
Manipulação dos rótulos, dos splits e dos resultados.
Pillow
Leitura e redimensionamento com reamostragem de Lanczos.
matplotlib
Curvas ROC, matrizes de confusão e as figuras da monografia.
Grad-CAM
Implementação própria com hooks, para ver onde a rede olha.
Gradio
Demonstração web que carrega os seis checkpoints e aceita imagem enviada.
EyePACS e Messidor-2
Base de treino e base externa de avaliação.
  • Figura 6 da monografia: a mesma imagem de fundo de olho sem retinopatia, em baseline, CLAHE e canal verde.
  • Figura 7: as mesmas três variantes aplicadas a uma imagem com retinopatia diabética.
  • Figura 2: decomposição da imagem nos canais de cor, que motiva a escolha do canal verde.
  • Figura 9: curvas ROC no conjunto externo Messidor-2, por arquitetura e variante.
  • Figura 13: mapas de Grad-CAM em casos reais de retinopatia do Messidor-2.

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Disponível para trabalho remoto em times internacionais

Nome
Thiago Sanches
Localização
Brasil · UTC−3 · trabalho remoto
Idiomas
Português nativo · inglês com fluência profissional
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Experiência

  • 5 anos

    em sistemas corporativos

  • 70%

    menos tempo por relatório novo

  • 50%

    menos latência em GraphQL

  • Workers

    processos assíncronos com filas em Redis